因素之一：原创思想之“少”。科学仪器毕竟只是一种工具，其根源还在于原创性科学思想的缺乏。中科院院士郭光灿曾说：“国外只要有人提出新的想法，我们很快就可以跟上并超越他们，但要做出领先的原创，我们还有一定距离。”原创性的科学思想较少，这固然与我国科学技术所处的发展阶段有关，也与缺乏学术自信、缺乏承担失败的勇气、缺乏积累有关。

     因素之二：合作创新之“难”。现在原创性的科学思想往往出现在交叉领域，科学仪器的研发，特别是大科学装置的研发，更需要不同领域科学家的合作创新。但目前科研体制中，不同学科之间、各学术机构之间还存在条块分割的情况，缺乏合作的顶层设计和指导。当然还有一个更现实的问题：一个项目，谁来做主导？出了成果，谁排在第一位？在采访中，不止一位科学家道出合作之难。

     因素之三：技术人才之“缺”。科学家的想法要通过技术人员来实现，原创性科研仪器往往是特别“定制”的单型号“孤品”。很少有企业会承担这种“定制”任务，一是觉得科学家们的要求很“怪异”;二是单做的话成本太高。因此，原创性科研仪器的研发需要一支特殊的技术人才队伍。以中科院为例，原来几乎每个研究所都有专门的技术人员，甚至是加工厂。如今，这支队伍实力大不如前，技术人才的严重匮乏，已经制约了科研仪器的研发。

      不少科学家表示，我国现行的科研管理体制也在某种程度上阻碍了创新性科研仪器设备的研发。有科学家表示：“现在科研经费的使用偏重于项目支持，一个科研项目大概3~5年就必须结题了，但仪器设备的研制要进行长时间的技术积累。因此，在项目驱动的科研经费划拨模式下，科研人员不太可能潜心技术研发。”