由于多种分析技术进展的结合，食品分析当中一些比较特别的应用领域也取得了很大的发展。如食品中挥发性成分的分析，其对于食品的品质和认可度有着十分重要的影响。食品或饮料中挥发性成分的研究，需要分析方法和技术不仅能够准确的评估它的组分，也能够监控它的组分分布，以及检测其中的痕量组分。

　　在过去的15-20年当中，由于新的方法的引入，分析策略发生了很大的变化，尤其是：(1)少溶剂样品制备技术;(2)快速GC及相关技术;(3)新的分析方法，如全二维GC;(4)新的操作策略，这些策略基于为其他领域所开发的方法，这些方法现在也用在食品分析上;(5)细致的数据处理获得更高水平的信息。因为手性方法可用于研究及表征食品或饮料，通过将不同食品化合物的对映体进行分离，如：氨基酸、农药、多酚等，所以手性分析法在食品分析中的应用有着重要的增长。另外一个例子是，通过感官感知的物理特性对食物口感进行究。为了研究食物的破裂，咬或咀嚼时发出的声音、它的微观结构、咀嚼和吞咽时的肌肉运动、可接受性等内容，这一领域的研究在过去十年中取得了巨大的进展，其研究手段是基于多学科的方法，包括化学、物理、生理学、心理学。

　　为了确保人体通过食物接触的有害物质残余物在人体健康所能接受的范围内，食品中有害物质的测定是必须的。因此，为了提高分析的回收率、降低检出限、减少分析时间或基质效应，强有力的分析方法一直在不断的发展当中。有趣的是，如今无论是开展研究还是监测项目，以及由此界定法规的检测限和执法，方法验证都是必须的。食品工业当中和食品分析相关的其他分析化学方法的应用包括：监控食品生产/操作链中的关键点，食品工业中加工过程的分析控制、快速在线筛选方法的开发、将研究方法转化为常规实验室可用的方法的验证计划等。

　　在过去几年中，质谱技术在食品分析中的应用发展也是值得关注的。过去十年，质谱常常和其他分离技术，如LC、CE联用，广泛的用于食品化合物的直接定性和定量分析。由于无法满足欧盟的最新标准，尤其是那些涉及鉴定分数要求的判断标准，因此单四极杆质谱仪在筛选方面的应用受到了限制。因此，串联质谱成了食品分析当中，用于鉴别分析物(主要是有害物质)，及对分析物进行定量分析的通用工具。如果注意避免离子抑制现象，串联质谱的高选择性将对简化萃取过程很有帮助。目前，关于三重四极杆、离子阱以及飞行时间质量分析器和一维或二维分离技术联用的应用，在食品分析科技文章中有大量的报道。此外，预计新型离子化技术的发展会比质量分析器技术的发展，为质谱在食品分析，包括新的组学应用中带来更广阔的空间。

　　蛋白质组学和代谢组学是强有力的分析平台，可获取食物组分更多的细节和更完整的信息，甚至超越了传统的食品成分分析方法。对于食品生物化学组成的全面了解，将有助于研究人员了解代谢网络，从而对重要的食品特征如风味、颜色、质地、香味、营养价值等有更深入的认识。在这种情况下，代谢组学研究(通过GC/MS、LC−MS、CE−MS或NMR)拥有显著增加作物学和食品学、食品原料质量和安全、食品贮存、保质期及后处理等价值的潜力。

　　在食品生产各个阶段进行的食品安全和质量评估中，转录组学、蛋白质组学及代谢组学方法的分析能力也得到了体现。它们也是区分相似食品，检测造假(掺假、产地造假、真实性等)食品、食源性致病菌、有毒物种、食物过敏原等的重要工具。例如，在食品安全的需求下，一些DNA微阵列芯片已经被开发用于检测食源性致病菌、有毒微生物，及转基因(GM)生物等。

　　在不同的阶段，蛋白质组学和代谢组学也会发生改变，如作物生长阶段，食品加工/制作(发酵，烤，煮等)、食品保存/存储(冷冻、烟熏、干燥等)等阶段。组学方法已经被证明对于深入了解食品及食品相关的基质分子非常有用，包括转基因食品。利用组学方法可得到转基因食品的有用指纹信息(可用于转基因食品的检测、成分监测、溯源、无意改性研究、标记问题等)，相关方法已经推荐给欧洲食品安全局。